Прибайкальский аймак Бурят-Монгольской АССР образован Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 12 декабря 1940 года путём выделения части территории Кабанского и Баргузинского аймаков. В состав Прибайкальского аймака вошли территории следующих сельсоветов: Усть-Баргузинского, Горячинского, Батуринского, Турунтаевского, Ильинского и Таракановского. Они утверждены Постановлением Секретариата Президиума Верховного Совета РСФСР от 2 июля 1942 года.

Усть-Баргузинский сельсовет передан в Баргузинский аймак Указом Президиума Верховного Совета РСФСР в 1945 году;

Таракановский сельсовет Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 16 июля 1957 года переименован в Таловский сельсовет;

Прибайкальский аймак был упразднён Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 1 февраля 1963 года с передачей его территории в состав Кабанского аймака и Прибайкальского промышленного аймака. 2 апреля 1963 года в состав Кабанского аймака включены Батуринский и Турунтаевский сельсоветы бывшего Прибайкальского аймака, а Посольский сельсовет передан в Прибайкальский промышленный аймак.

Прибайкальский аймак вновь образован Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 11 января 1965 года за счёт территории упразднённого Прибайкальского промышленного аймака и передачи части территории Кабанского аймака. Город Бабушкин, рабочие посёлки Выдрино, Селенгинск, Каменск и Танхой, а также Посольский сельсовет переданы из Прибайкальского аймака в Кабанский. Батуринский и Турунтаевский сельсоветы из Кабанского района переданы в Прибайкальский аймак.

Гремячинский сельсовет образован Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 21 июля 1966 года путём разукрупнения Горячинского сельсовета;

Татауровский сельсовет образован Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 21 июля 1966 года за счёт разукрупнения Ильинского сельсовета;

Итанцинский сельсовет образован Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 26 декабря 1967 года за счёт разукрупнения Турунтаевского сельсовета;

Батуринский сельсовет Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 27 декабря 1967 года переименован в Зырянский сельсовет;

Туркинский поселковый совет образован Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 13 ноября 1974 года и упразднён Горячинский сельсовет. Тогда же Ильинский сельсовет приобрёл статус поселкового совета;

Нестеровский сельсовет образован Указом Президиума Верховного Совета Бурятской АССР от 29 июня 1976 года за счёт разукрупнения Зырянского сельсовета.

В октябре 1977 года Прибайкальский аймак Бурятской АССР переименован в Прибайкальский район.